Mobile Suit Gundam: Char's Counterattack

우주세기 0093년. 샤아 아즈나블은 신생 네오 지온군을 통솔하여 스스로 총수가 되어 지구연방 정부에 대해 또다시 싸움을 걸어왔다.

샤아는 지구의 중력에 묶여 자기중심적인 지배를 계속하고 있는 인류를 숙청하기 위해서, 지구에 운석을 떨어뜨림으로써 지구를 거주할 수 없는 별로 만들기 위한 작전을 전개. 그 폭거를 저지하기 위해 브라이트와 아무로가 소속된 지구연방군 론도 벨 부대가 출격하지만 소행성 5th 루나의 낙하를 막을 수는 없었다.

샤아는 다음 작전으로 이행하여, 과거 네오 지온의 본거지였던 액시즈의 탈환과 루나 II에 저장된 핵 미사일의 탈취를 꾀한다. 그리고 작전수행의 일환인 위장 평화교섭을 위해 지구연방 정부와의 교섭 장소인 사이드 1의 콜로니, 론데니온으로 향한다.

한편 아무로도 자신이 개발에 참가한 ν건담을 애너하임의 공장에서 수령한 후에 평화교섭이 이뤄지는 론데니온에 도착해 있었다. 론데니온에서 연방정부 참모 차관의 딸 퀘스와, 브라이트의 아들인 하사웨이와 만난 아무로는 콜로니 안에서 휴식을 취하던 중에 우연하게도 평화교섭을 끝낸 샤아와 조우하게 된다. 그리고 샤아의 말에 감화된 퀘스는 그와 함께 아무로의 곁에서 떠나버린다.

샤아는 론데니온에서 연방정부와 맺은 평화교섭을 이용하여 무장해제를 위장하여 루나 II를 공격하고, 액시즈를 강탈하는 작전을 실행. 네오 지온의 함대는 루나 II에 괴멸적인 타격을 가하고 핵병기의 탈취에 성공했으며, 뒤이어 샤아 자신도 액시즈를 지키는 부대를 섬멸. 목적대로 핵병기와 액시즈를 손에 넣었다.

제2의 운석으로서 액시즈를 지구에 떨어뜨리려하는 샤아. 그것을 저지하기 위해 행동을 개시하는 아무로와 브라이트가 이끄는 론도 벨 부대.

지구의 운명을 걸고, 두 사람의 뉴타입에 의한 최후의 싸움이 막을 연다!